Valstybės kontrolės auditas parodė, kad MTEP mokesčių lengvata pasinaudojo 122 iš 301 tiesioginę valstybės paramą inovacijoms gavusios įmonės – 41 proc. Auditoriai teigia, kad reikšmingai daliai inovatyvaus verslo kelią užkerta sudėtingos procedūros ir duomenų dubliavimas.
2022–2024 metais inovacinei veiklai skirtos pelno mokesčio lengvatos valstybės biudžetui vidutiniškai kainavo 179 mln. eurų per metus. Tačiau bendras MTEP lengvatomis pasinaudojusių įmonių skaičius per trejus metus sumažėjo 5 proc. – nuo 2 869 iki 2 714.
Audite pagrindinėmis kliūtimis įvardyti sudėtingas administravimas, dideli dokumentavimo reikalavimai ir neapibrėžtumas, kaip vertinama MTEP veikla. Apklausose 24 proc. įmonių nurodė, kad lengvata joms neaktuali dėl pelno nebuvimo ankstyvaisiais veiklos metais. Dar 17 proc. teigė stokojančios kompetencijų tinkamai dokumentuoti MTEP veiklą, o 16 proc. procesą vadino pernelyg sudėtingu ir ilgu.
Įmonės turi pakartotinai teikti institucijoms dokumentus, kuriuos valstybė jau turi savo registruose, įskaitant metines pelno mokesčio deklaracijas ir MTEP išlaidų ataskaitas. Pareiškėjų tokių duomenų prašoma Inovacijų agentūrai ir Centrinei projektų valdymo agentūrai, nors juos jau turi VMI ar Valstybės duomenų agentūra.
Beveik pusė MTEP lengvata besinaudojančių įmonių yra labai mažos, tačiau joms taikomi tokie pat dokumentavimo reikalavimai kaip ir didelėms bendrovėms. Valstybės kontrolierė Irena Segalovičienė teigė, kad kai daugiau nei pusė įmonių lengvatos atsisako dėl administracinės naštos ir pasikartojančio duomenų pateikimo, valstybė neišnaudoja paskatos potencialo.
Valstybės kontrolė siūlo įteisinti standartizuotų įkainių modelį, sudaryti sąlygas VMI, Valstybės duomenų agentūrai ir administruojančioms institucijoms keistis MTEP išlaidų duomenimis bei atsisakyti perteklinių reikalavimų. Taip pat rekomenduojama plėsti inovacijų mokesčių lengvatas intelektinės nuosavybės kūrimui, apsaugai ir komercializavimui.
Įgyvendinus rekomendacijas, tiesioginę valstybės paramą inovacijoms gavusių įmonių, pasinaudojančių MTEP lengvata, dalį siekiama padidinti nuo 41 iki 80 proc. Ekonomikos ir inovacijų ministerija liepos 16 dieną pareiškė jau įgyvendinanti rekomendacijas, skirtas aiškesniam MTEP veiklų pripažinimui, mažesnei administracinei naštai ir paprastesniam išlaidų pagrindimui.
